Yazar "Çiçek, Cemal" seçeneğine göre listele
Listeleniyor 1 - 3 / 3
Sayfa Başına Sonuç
Sıralama seçenekleri
Öğe Giardia intestinalis izolatlarının genotiplendirilmesi(Trakya Üniversitesi, 2013) Çiçek, Cemal; Şakru, NerminGiardia intestinalis su ve gıda kaynaklı salgınlara neden olabilen, insanlarda sık görülen protozoondur. Dünya'da ve Türkiye'de önemli bir halk sağlığı sorunudur. Bu çalışmanın amacı; insanlardan elde edilen Giardia intestinalis izolatlarının moleküler yöntemlerle analizidir. 01 Eylül 2011-31 Nisan 2013 tarihleri arasında Trakya Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi ve Edirne Devlet Hastanesine başvuran kişilerin dışkılarından elde edilen 39 izolat çalışmaya alındı. Örnekler ilmiğe dayalı izotermal çoğaltma yöntemi ile analiz edildi. Ayrıca bu izolatlardaki beta giardin geni polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılıp, dizi analizi yapıldı. Otuz dokuz örneğin 32'sinde (%82) ilmiğe dayalı izotermal çoğaltma yöntemi ile pozitiflik saptandı. Polimeraz zincir reaksiyonu ile pozitiflik saptanan 19 örneğin 17'si genotiplendirildi. Genotiplendirme sonucunda, örneklerin dokuzu Genotip A ve sekizi Genotip B olarak belirlendi. Semptomatik olgularda Genotip B (%62.5), asemptomatik olgularda ise Genotip A (%66.7) daha fazla görüldü. Semptomatik/asemptomatik olgular ile genotipler arasında istatistiksel anlamlılık saptanmadı (p=0.347). Polimeraz zincir reaksiyonu pozitifliği ile kist yoğunluğu arasında anlamlı istatistiksel fark bulundu (p=0.0001). Ek olarak aynı farklılık polimeraz zincir reaksiyonu ile DNA konsantrasyonu arasında da bulundu (p=0.0001). Sonuç olarak moleküler yöntemlerden, ilmiğe dayalı izotermal çoğaltma ve polimeraz zincir reaksiyonu yöntemlerinin kullanılması Trakya bölgesinde ortaya çıkabilecek salgınların analizinde ve yapılacak epidemiyolojik çalışmalarda yol gösterici olacaktır.62 Anahtar kelimeler: Giardia intestinalis, Polimeraz zincir reaksiyonu, genotip, Trakya, TürkiyeÖğe Surprising Visitor at Emergency Operating Table: Taenia saginata(2020) Şakru, Nermin; Oğuz, Serhat; Çiçek, Cemal; Aksoy, Hüseyin Can; Yağcı, Mehmet Ali[Abtract Not Available]Öğe Trakya Bölgesi'ndeki Giardia intestinalis İzolatlarının Genotiplendirilmesi(2015) Çiçek, Cemal; Şakru, NerminGiardia intestinalis su ve gıda kaynaklı salgınlara neden olabilen, insanlarda sık görülen bir protozoondur. Dünyada ve Türkiye'de önemli bir halk sağlığı sorunu oluşturmaktadır. G.intestinalis'in epidemiyolojisi, genetik popülasyonu ve taksonomisini belirlemede moleküler teknikler yaygın olarak kullanılmaktadır. G.intestinalis'in insanlarda genotip A ve genotip B olmak üzere iki genotipi bulunmaktadır. Bu çalışmanın amacı; insanlardan elde edilen G.intestinalis izolatlarının moleküler yöntemlerle analizidir. Çalışmaya, Eylül 2011-Nisan 2013 tarihleri arasında, Trakya Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi ve Edirne Devlet Hastanesine başvuran kişilerin (30 erkek, 9 kadın; yaş aralığı: 1-74 yıl, ortanca yaş: 20) dışkılarından elde edilen 39 izolat alınmıştır. Hem nativ hem de lugol yöntemiyle mikroskobik olarak incelenen her örnekte, x400'lük büyütmede en az 50 alan taranarak ortalama kist sayısı saptanmıştır. Daha sonra örnekler, ilmiğe dayalı izotermal çoğaltma yöntemi (LAMP) ile uzama faktörü-1 alfa (EF-1?) gen bölgesi ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile de beta-giardin (bg) gen bölgesinin varlığı yönünden analiz edilmiş; ayrıca bg geninin dizi analizi yapılmıştır. Otuz dokuz örneğin 32'sinde (%82) LAMP yöntemiyle, 19'unda ise (%48.7) PCR ile, sırasıyla EF-1? ve bg pozitifl iği saptanmıştır. Genotiplendirmenin yapılabildiği 17 örneğin dokuzu genotip A, sekizi genotip B olarak belirlenmiş; alt genotipler olarak A2 (n= 6), A3 (n= 3), B2 (n= 6), B3 (n= 1) ve B4 (n= 1) tanımlanmıştır. Semptomatik 21 olgunun tiplendirilebilen sekiz izolatında genotip B (n= 5)'nin, asemptomatik 18 olgunun tiplendirilebilen dokuz izolatında ise genotip A (n= 6)'nın daha fazla görüldüğü izlenmiştir. Semptomatik ya da asemptomatik olgular arasında genotipler açısından istatistiksel olarak anlamlı fark saptanmamıştır (p= 0.347). PCR pozitifl ik oranı, kist yoğunluğu yüksek ve düşük olan olgular arasında anlamlı fark göstermiştir (p= 0.0001). Sonuç olarak, LAMP ve PCR gibi moleküler yöntemlerin kullanılması, ortaya çıkabilecek salgınların analizinde yol gösterici olacaktır. Ayrıca bölgemizdeki G.intestinalis alt tip tanımlamasının, global epidemiyolojik verilere katkıda bulunacağı düşünülmektedir
